流式图比例显示问题，数据是否可靠？

wenruiting

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各位老师好：
有几个问题想请教大家:
1. 流式图上显示的比例和显示的细胞数量不符（第1个图），比如右上象限比例显示25.3% 但细胞的数量明显看着比右下象限的数量多。本数据采用flowjo软件调出来，压在线下有一群细胞（第2个图）。请问各位老师这样的数据可靠吗？（备注：共标记了4个marker：CD34-PE, CD38-FITC, CD45RA-APC,CD90-pecy7；流式机为：BD C6机器）
2. 是否可以先在这个图上圈出R1门（第3个图）（也就是排除压在线上的细胞）然后再分析R1门来源的CD90和CD45RA这个图呢？
3. 当右下象限细胞的比例表达低时，不存在上述情况（第4个和第5个图）。
请问各位老师，第1张图的数据是否可靠？为什么会出现细胞群压在线下的问题（补偿的问题？）？ 如何解决压在线下这群细胞的问题？谢谢大家！

wenruiting

期待各位老师的指导！

niwanmao

1、显示不符，是因为你Q4-4大量细胞在负轴，就是在坐标外面，这从图2伪彩色图一目了然。
但这么明显的压轴，说明补偿肯定没有调好，所以拿出去都得被人家质疑。所以第一要务是调节好补偿。
2、如果你先圈R1，再分析，这说什么把压轴的信号全切掉了，这是错误的。
3、还是第一点所说的，先调好补偿。

wenruiting

niwanmao 发表于 2018-11-22 08:53
1、显示不符，是因为你Q4-4大量细胞在负轴，就是在坐标外面，这从图2伪彩色图一目了然。
但这么明显的压轴 ...

谢谢倪老师！