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关于双指数运算(Biexponential)的问题

2013-8-26 21:55| 发布者: niwanmao| 查看: 4475| 评论: 15|原作者: 一直有理、haven_t

摘要: 我们用BD Canto II,有双指数(Biexponential)的选项,我想知道在什么情况下该使用?以我目前的有限经验,感觉这个选项很好用,几乎总是使用。那为什么不设置成默认呢?请看一直有理站友和haven_t站友之间的问答。 ...
@一直有理 站友提问:
在这里搜了下双指数的问题,只找到一篇。我们用BD Canto II,有双指数(Biexponential)的选项,我想知道在什么情况下该使用?以我目前的有限经验,感觉这个选项很好用,几乎总是使用。那为什么不设置成默认呢?换句话说,什么情况下不应该使用双指数?
另外,双指数的原理是什么?大概讲一下就可以,太详细也没用。
我搜到的之前说双指数的帖子说了,在双指数下不要调电压,但是我遇到过背景过高,双指数后电压需要下调的情况,这时还是需要调节吧?
谢谢大家不吝赐教!

@haven_t 站友回复:
对数坐标不能显示负值数据,而双指数可以。至于原理和对数一样,只是函数不一样而已,双指数函数曲线在数值大的区间接近对数曲线,接近0的地方接近线性。
Diva的双指数是自动根据最小值算的,如果某些数据有个别细胞荧光强度特别低,整个图形就往右漂移,如果是Pattern Recognition分析结果会误导操作者。
在双指数下不要调电压是错误的说法!
Diva的Biexponential是自动算出负值范围,坐标的基线随负值区漂移。所以如果标本有极少数细胞荧光强度特别低,阴性群体和弱阳性会被压缩,视觉上群体的分布就改变了。当然Diva可以固定负值区,增加图形的可比性。

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最新评论

引用 haven_t 2013-8-23 11:44
对数坐标不能显示负值数据,而双指数可以。至于原理和对数一样,只是函数不一样而已,双指数函数曲线在数值大的区间接近对数曲线,接近0的地方接近线性。
Diva的双指数是自动根据最小值算的,如果某些数据有个别细胞荧光强度特别低,整个图形就往右漂移,如果是Pattern Recognition分析结果会误导操作者。
在双指数下不要调电压是错误的说法!
引用 niwanmao 2013-8-23 18:32

双指数是不是就是logicle?
引用 niwanmao 2013-8-23 19:20
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicle转换,觉得确实靠近0轴附近的变换特别大,对于一般的表达率检测可能问题不大,但是在临床上,识别一种细胞是否有问题,往往需要仔细区分其抗原表达的轨迹,例如S形、L型之类的(也就是@haven_t 这里所说的pattern recognition),如果经过logicle转换,可能会使这些形状发生改变,对我们判断这类细胞是否异常产生干扰。

引用 tanweifeng 2013-8-25 16:44
正如二楼所说双指数的最大优点是能显示0以下数值,这样能使0以下数据不再压在坐标轴上,有利于画门操作。
至于为什么不设定为默认模式,我认为是因为不是所有的数据都有0以下数值,如FSC和SSC,还有在没有调节补偿的数据都不会出现0以下数值,
引用 samly0 2013-8-26 10:29
niwanmao 发表于 2013-8-23 19:20
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicl ...

那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表达轨迹也是无数经验总结分析的结果吧
引用 samly0 2013-8-26 10:32
最近正好在学着用BD Canto II,也对Biexponential有这些疑问,这里太好了,得到指点了
引用 niwanmao 2013-8-26 10:36
samly0 发表于 2013-8-26 10:29
那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表 ...

呵呵,是有可能,但属于非主流吧:)
引用 haven_t 2013-8-26 11:41
samly0 发表于 2013-8-26 10:29
那是不是熟悉logicle转换后的形状,就不会对判断产生干扰了?,我想pattern recognition显示的抗原表 ...

Diva的Biexponential是自动算出负值范围,坐标的基线随负值区漂移。所以如果标本有极少数细胞荧光强度特别低,阴性群体和弱阳性会被压缩,视觉上群体的分布就改变了。当然Diva可以固定负值区,增加图形的可比性。
引用 一直有理 2013-9-29 11:07
niwanmao 发表于 2013-8-23 19:20
查了下,双指数是logicle转换。原理应该是@haven_t 所说。至于为什么默认不设置为双指数,我试了几次logicl ...

谢谢倪老师,我们是做试剂的,对于临床的应用真不是精通,谢谢您指点。
关于pattern recognition,我可以举出的例子就是CD11b,双峰头。但是这些不是都应该建立在阳性区域的表达上么?什么样的峰型也得让它出现在阳性区吧?而且这些我们熟悉的峰型也应该是对数坐标才出现的吧?
引用 一直有理 2013-9-29 11:11
haven_t 发表于 2013-8-26 11:41
Diva的Biexponential是自动算出负值范围,坐标的基线随负值区漂移。所以如果标本有极少数细胞荧光强度特 ...

您的意思是由于为了照顾那些极少数特别低的值而左移了基线,所以某些弱阳性的群会跑到较高的坐标处,从而压缩了其分布。是这个意思么?着我还真没想到过,谢谢指点。
引用 一直有理 2013-9-29 11:14
怎么给出最佳答案结束这个悬赏我不会啊,麻烦倪老师弄一下,谢谢啦
引用 niwanmao 2013-9-29 11:20
一直有理 发表于 2013-9-29 11:07
谢谢倪老师,我们是做试剂的,对于临床的应用真不是精通,谢谢您指点。
关于pattern recognition,我可以 ...

模式识别不一定全在阳性区域,抗原的分化有一定的规律,详见:http://www.flowcyto.cn/bbs/reade ... HhRicg9B5owVhb30VV4
第4、8、14等页的正常细胞分化,正常细胞在散点图上有其一定的分布,例如S形、直角形等,而且强度也有一定的要求。如果转换为logicle,图形会出现缩,尤其是阴性区域,可能会存在一些误判。
引用 一直有理 2013-9-30 10:33
niwanmao 发表于 2013-9-29 11:20
模式识别不一定全在阳性区域,抗原的分化有一定的规律,详见:http://www.flowcyto.cn/bbs/reader.php?mo ...

谢谢倪老师
引用 一直有理 2013-9-30 10:34
niwanmao 发表于 2013-9-29 11:20
模式识别不一定全在阳性区域,抗原的分化有一定的规律,详见:http://www.flowcyto.cn/bbs/reader.php?mo ...

您十月份来血研所开会么?
引用 niwanmao 2013-9-30 15:50
一直有理 发表于 2013-09-30 10:34:07


您十月份来血研所开会么?

那个会好像是病理和临床的为主吧,流式的内容没注意到。我可能不去。

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