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标题: 第一次做CFSE增殖检测,想请倪老师帮忙看下数据,非常感... [打印本页]

作者: 六轮花开    时间: 2012-12-10 15:48
标题: 第一次做CFSE增殖检测,想请倪老师帮忙看下数据,非常感...
本帖最后由 六轮花开 于 2012-12-12 16:28 编辑

麻烦倪老师帮忙看看这6个实验管的情况,测的时候初看只有6和8有双峰,但是我不确定是不是分代峰,因为只有这两管里包含两种细胞,APC和脾淋巴细胞,可是只有脾淋巴细胞是染了CFSE的呀,请问倪老师这两管是增殖了吗?如果是,增殖有差异吗?第一次做,还没学会软件使用,但是很想知道这次结果怎么样,谢谢老师!


12-12号
1-空白管
2-CD25-PE 单染
3-Foxp3-PE-Cy5 单染
4-IgG-PE-Cy5 同型对照
5-CFSE 单染
6-10管为实验管。都染了CFSE,CD25 和Foxp3

CD25好像染的不太好。我很想知道这次细胞增殖的数据是不是可用。另外看CD25+Foxp3+和CD25-Foxp3-两群细胞分别的增殖情况怎样。麻烦倪老师了!!非常感谢!!


作者: niwanmao    时间: 2012-12-10 15:48
顺序倒还好的,三个压缩包解压到一个目录下,就排列好了。
但是很奇怪,3难道没有染CFSE吗?为什么一点荧光都没有。
其它几管如果按照2作为父代,还是可以拟合出来的,但是不明显。
作者: 六轮花开    时间: 2012-12-10 21:09
niwanmao 发表于 2012-12-10 20:47
顺序倒还好的,三个压缩包解压到一个目录下,就排列好了。
但是很奇怪,3难道没有染CFSE吗?为什么一点荧光 ...

哦哦是的,第3管只有没染CFSE的APC细胞,是阴性对照。倪老师觉得增殖不明显是不是因为培养时间不够长?这是染CFSE后培养3天测的,同一批处理的细胞还有复孔,我打算培养第5天的时候再去测,到时候再看看数据怎么样?谢谢倪老师~
作者: niwanmao    时间: 2012-12-10 21:18
六轮花开 发表于 2012-12-10 21:09
哦哦是的,第3管只有没染CFSE的APC细胞,是阴性对照。倪老师觉得增殖不明显是不是因为培养时间不够长?这 ...

这个条件很难说,多数情况下都很难做到象说明书上那么典型的,不知道你这个幻灯片看过没有?
http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-1969-1-1.html
里面讲得非常详细,可以参考和琢磨一下
作者: 六轮花开    时间: 2012-12-12 16:18
niwanmao 发表于 2012-12-10 15:48
顺序倒还好的,三个压缩包解压到一个目录下,就排列好了。
但是很奇怪,3难道没有染CFSE吗?为什么一点荧光 ...

倪老师,我今天又把培养5天的细胞测了流式,这次上机前另外又染了CD25和Foxp3.希望倪老师能帮我看一下这次的增殖明显吗,数据可用吗?非常感谢!这里不能传附件,我放在楼顶了~
作者: niwanmao    时间: 2012-12-12 17:38
六轮花开 发表于 2012-12-12 16:18:52
[quote]niwanmao 发表于 2012-12-10 15:48 [url=forum.php?mod=redirect&g

你可能用的是快捷回复的窗口,要上传附件,需要点击窗口右上的“高级模式”,进入高级编辑窗口,就可以了。

数据现在暂时没办法看,等会儿回去再帮你分析看看。
作者: niwanmao    时间: 2012-12-12 22:35
六轮花开 发表于 2012-12-12 16:18
倪老师,我今天又把培养5天的细胞测了流式,这次上机前另外又染了CD25和Foxp3.希望倪老师能帮我看一下这 ...

以第10管为例,可以看到,绝大多数都是CD25-FOXP3-的细胞:
CD25-foxP3-的增殖
[attach]2393[/attach]


而CD25+foxP3-的细胞很少,见下面CD25+foxP3-的增殖图,这样就造成模型在拟合上准确性不佳。至于CD25+foxP3+这群双阳性的Treg更是几乎看不到了。
[attach]2394[/attach]


我个人建议的解决方法是:
如果你的目的就是分析CD25+的细胞,那么建议在获取时,可以只获取CD25+那群细胞,并使其细胞总数尽可能达到2-3万以上。

作者: 六轮花开    时间: 2012-12-13 09:47
niwanmao 发表于 2012-12-12 22:35
以第10管为例,可以看到,绝大多数都是CD25-FOXP3-的细胞:
CD25-foxP3-的增殖

我昨天染的CD25不太好,没怎么染上。用的ebioscience的 Treg细胞试剂盒,原来这个试剂盒染的一直不错的。今天再重新染一下看看。真是麻烦您了,非常非常感谢!另外,我昨天的数据如果不分细胞群,单看脾淋巴细胞的增殖的话,增殖明显吗?第8管和第10管有差异吗?谢谢您!
作者: niwanmao    时间: 2012-12-13 14:31
六轮花开 发表于 2012-12-13 09:47
我昨天染的CD25不太好,没怎么染上。用的ebioscience的 Treg细胞试剂盒,原来这个试剂盒染的一直不错的。 ...

晚上回去看看,现在用的是公用电脑。
作者: 六轮花开    时间: 2012-12-13 15:35
这是今天染了测的,跟昨天的10管对应的完全一样。最后的一批复孔了,测的时候获的细胞比较多,不知道跟昨天相比结果有没有好一点。麻烦倪老师了!真的非常感谢!

作者: 六轮花开    时间: 2012-12-13 15:36
niwanmao 发表于 2012-12-13 14:31
晚上回去看看,现在用的是公用电脑。

麻烦您帮我把今天测的也一起看看好吗。还是看看总体脾淋巴细胞的增殖情况和分别的两群细胞的情况。非常非常感谢。数据放在了楼上
作者: niwanmao    时间: 2012-12-13 21:36
六轮花开 发表于 2012-12-13 09:47
我昨天染的CD25不太好,没怎么染上。用的ebioscience的 Treg细胞试剂盒,原来这个试剂盒染的一直不错的。 ...

第8管的结果就是这样,第10管见前面的帖子,是否有区分请结合你的实验进行判断。
[attach]2424[/attach]


作者: niwanmao    时间: 2012-12-13 21:46
六轮花开 发表于 2012-12-13 15:35
这是今天染了测的,跟昨天的10管对应的完全一样。最后的一批复孔了,测的时候获的细胞比较多,不知道跟昨天 ...

你可能主要是要看8号和10号,所以就给你分析这两个,我觉得还是只能看全部的细胞,因为CD25+的和foxP3阳性的细胞太少了。:
8号双阴性
[attach]2425[/attach]

8号CD25+foxP3-
[attach]2426[/attach]

10号双阴性
[attach]2427[/attach]

10号CD25+foxP3-
[attach]2428[/attach]

作者: 六轮花开    时间: 2012-12-14 09:24
谢谢倪老师!辛苦您了!我确实主要想看8和10有没有差异。如果不分细胞,就看总体的,这两管有显著差异吗?哪管增殖更明显呢?很惭愧,我不大会看这个数据。。。
不知道为什么染色不太好,不知道是不是因为这次细胞量太大,用的抗体量相对来说有点少了。
作者: niwanmao    时间: 2012-12-14 12:33
六轮花开 发表于 2012-12-14 09:24
谢谢倪老师!辛苦您了!我确实主要想看8和10有没有差异。如果不分细胞,就看总体的,这两管有显著差异吗? ...

就是看图上那些数字,我帮你整理一下双阴性细胞的增殖情况,从数据上看,10号增殖相对明显些。
                       8号(%)                          10号(%)
parent             36.19                                 29.74
2代                 0.19                                   5.13
3代                 0.00                                    0.00
4代                 53.72                                  44.98
5代                 9.90                                   20.15

但是CD25+的细胞数量太少,虽然你也可以按照这样的方式比较,但可能意义不大。
其实CD25+的细胞少并不是你染色没染好的缘故,而是这种细胞本来就少,没有办法的。
作者: 六轮花开    时间: 2012-12-18 12:29
niwanmao 发表于 2012-12-14 12:33
就是看图上那些数字,我帮你整理一下双阴性细胞的增殖情况,从数据上看,10号增殖相对明显些。
          ...

好的。谢谢您!




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