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标题: 分析平均荧光强度该用Mean fluorescence intensity还是median fluores... [打印本页]

作者: 实验猿 时间: 2016-7-4 20:59
标题: 分析平均荧光强度该用Mean fluorescence intensity还是median fluores...
在看文献的时候发现有的用Mean fluorescence intensity表示平均荧光强度，有的用median fluorescence intensity，到底该用哪个？请各位指教！

作者: niwanmao 时间: 2016-7-4 21:11
一般Mean可能指的是Geomean（几何平均数）。这是最常用的。如果荧光分布呈正态分布，Geomean和median等同。
详解请看这里：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-3483-1-1.html

作者: 实验猿 时间: 2016-7-4 21:14
我分析的是细菌上的荧光强度，您觉得我用哪个较好呢？

作者: 实验猿 时间: 2016-7-4 21:22
http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？

作者: 实验猿 时间: 2016-7-4 21:23

niwanmao 发表于 2016-7-4 21:11
一般Mean可能指的是Geomean（几何平均数）。这是最常用的。如果荧光分布呈正态分布，Geomean和median等同。 ...

http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？

作者: niwanmao 时间: 2016-7-4 21:35

实验猿发表于 2016-7-4 21:23
http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？ ...

站内不是写过类似的帖子吗：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html
MFI一般就是指Geomean，除非特殊说明是Median

作者: 实验猿 时间: 2016-7-4 21:44

niwanmao 发表于 2016-7-4 21:35
站内不是写过类似的帖子吗：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html
MFI一般就是指Geomean，除 ...

谢谢老师的解答，我测的是log数据，那就用median了

作者: niwanmao 时间: 2016-7-5 13:00

实验猿发表于 2016-7-4 21:44
谢谢老师的解答，我测的是log数据，那就用median了

如果峰不呈正态分布，建议还是用Geomean

作者: 实验猿 时间: 2016-7-5 16:58

niwanmao 发表于 2016-7-5 13:00
如果峰不呈正态分布，建议还是用Geomean

那处理数据作图时，是标mean fluoresence intensity还是Geomean fluoresesence intensity？我看文献上通常标的是mean fluoresence intensity或median fluoresence intensity

作者: niwanmao 时间: 2016-7-5 18:18

实验猿发表于 2016-7-5 16:58
那处理数据作图时，是标mean fluoresence intensity还是Geomean fluoresesence intensity？我看文献上通 ...

一般用简称MFI，第一次提的时候用全称mean fluoresence intensity。median很少看到。

作者: 实验猿 时间: 2016-7-5 19:09

niwanmao 发表于 2016-7-5 18:18
一般用简称MFI，第一次提的时候用全称mean fluoresence intensity。median很少看到。 ...

好的，非常感谢倪老师的解答

作者: 实验猿 时间: 2016-7-6 20:48

niwanmao 发表于 2016-7-5 18:18
一般用简称MFI，第一次提的时候用全称mean fluoresence intensity。median很少看到。 ...

因为荧光强度通常用LOG模式获取，故算术平均数此时无法统计此类数据，就需要改用几何平均数（gMFI）。但值得一提的是，gMFI对于log正态分布的数据代表性非常好，但对于倾斜同样非常敏感（大家可以用实际数据试试）。因此，对于非正态的数据，只剩下中位数可用了，中位数受数据的倾斜、极端值等影响很小。所以在目前情况下，一般来说，中位数是最安全的MFI指标。这个解释跟您上边跟我说的“如果峰不是正态分布，建议用Geomean”相矛盾啊

作者: niwanmao 时间: 2016-7-6 20:54

实验猿发表于 2016-7-6 20:48
因为荧光强度通常用LOG模式获取，故算术平均数此时无法统计此类数据，就需要改用几何平均数（gMFI）。但 ...

对，我前面说错了，以你转的帖子中观点为准：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2427-1-1.html

作者: 实验猿 时间: 2016-7-6 21:22

niwanmao 发表于 2016-7-6 20:54
对，我前面说错了，以你转的帖子中观点为准：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2427-1-1.html ...

哦，谢谢老师每次都耐心解答我的问题，麻烦您了！

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