关于CD45RO和RA的问题

船长不好奇

老师您好，我的降维分析中会有CD45RA和RO双阳的细胞群，请问一下这是正常现象还是因为其他干扰因素？我查文献报道双阳的文献还是1994年的，没看到近年来有这样的说法。

niwanmao

是不是降维图上面用彩虹色显示表达水平？是否有可能因为仪器设置不当导致两者都在比较高的坐标，导致降维之后被误认为双阳了

船长不好奇

是的，下图是RA 和RO降维后，抗体的表达分别图。仪器设置是公司的工程师调整的，具体我不太清楚。这个是质谱流式，上机时候我没有进行仪器的调整。不知道是不是您说的这个原因。有什么办法鉴别和解决吗？

船长不好奇

二维看的话是没有双阳群的，还是降维的问题，请问降维这种干扰的情况下，我能只选择一种作为注释参考吗？比如以RA为标准，RA-的认为是RO+，这样可以吗？如果可以的话，更推荐哪个作为参考，两者之间有没有更优？

niwanmao

船长不好奇 发表于 2024-5-20 10:48
二维看的话是没有双阳群的，还是降维的问题，请问降维这种干扰的情况下，我能只选择一种作为注释参考吗？比 ...

RA和RO之间，是存在一个渐变过程，所以你这里标识的信号，应该是处于中间阶段，那时RA和RO都是弱表达，但没有完全阴性，这是正常存在的。

船长不好奇

niwanmao 发表于 2024-5-20 10:58
RA和RO之间，是存在一个渐变过程，所以你这里标识的信号，应该是处于中间阶段，那时RA和RO都是弱表达，但 ...

老师，那这种状态下的细胞，我在注释的时候，应该怎么分群呢？归为哪一类呀

niwanmao

船长不好奇 发表于 2024-5-20 11:04
老师，那这种状态下的细胞，我在注释的时候，应该怎么分群呢？归为哪一类呀 ...

不应该根据这个降维图分群，而是应该根据对应的二维图逐级设门确认细胞表型。

船长不好奇

niwanmao 发表于 2024-5-20 12:22
不应该根据这个降维图分群，而是应该根据对应的二维图逐级设门确认细胞表型。

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好的 ，谢谢老师