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[细胞周期] 请问modfit diagnostics各项的参考值,对吗?

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发表于 2013-3-6 22:55:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
本帖最后由 FCS 于 2013-3-6 22:59 编辑

%CV: coefficient of variation 变异系数   <8%?
%Aneuploid: 非整倍体,?
Cell: 细胞数,>10000?
Avg Cell: average cell?

%B.A.D.: Debris and aggregation   <20%?
RCS: Reduced Chi-Square RCS<5?



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%Aneuploid只有在你设置了异倍体分析的时候才会出现数字,一般不需要。 Avg Cell是每个channel的平均细胞数,例如G0的最左边界为50,G2最右边界为200,那么它们之间的跨度为150,就需要你至少收集15000个细胞,以保证S期评估的准确性。 其实以上指标在modfit软件的fit diagnosis窗口,点击相应的按钮都可以看到详细的解释的,你可以试试看。 ...
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发表于 2013-3-6 22:55:54 | 显示全部楼层

%Aneuploid只有在你设置了异倍体分析的时候才会出现数字,一般不需要。

Avg Cell是每个channel的平均细胞数,例如G0的最左边界为50,G2最右边界为200,那么它们之间的跨度为150,就需要你至少收集15000个细胞,以保证S期评估的准确性。

其实以上指标在modfit软件的fit diagnosis窗口,点击相应的按钮都可以看到详细的解释的,你可以试试看。
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发表于 2013-3-6 23:24:34 | 显示全部楼层
modfit软件拟合后,在fit diagnosis窗口中都有各个指标的说明及其参考文献,为了方便你理解,帮你找了点资料:

%CV,指的是 G0/G1 期峰的 CV 值,最好<8%,对于实体组织来说,这个标准比较难达到,但应该尽可能达到,CV 值过大,不仅直接影响到 S 期所占比率的计算,还会给倍体的分析带来困难,因为有可能会掩藏了一个不正常的峰;
Cell #,指的是用于拟合分析的细胞数,不能少于10000 个;

RCS,是一个统计学上的指标,用来反应你所选择的这个模式与你的标本的拟合程度,0.9-3.0 为比较好的一个范围,而 3.0-5.0为可以接受,小于 0.8 或是大于 5.0,都被视为不可接受;

%B.A.D,指的是背景中的碎片和聚集体所占的比率,需小于 20%
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 楼主| 发表于 2013-3-7 13:01:34 | 显示全部楼层
谢谢倪老师,Avg Cell是average cell吗?它的参考值是多少?还有%Aneuploid?
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 楼主| 发表于 2013-3-7 14:32:33 | 显示全部楼层
谢谢倪老师告诉我的惊喜!!
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