论文里完美的流式图是怎么做出来的？

farmer000

这篇文章中不同指标阈值标准统一，图片完美，是怎样做到的？
能调成一致感觉非常神，请大侠指点一下，如何做出如此完美流式图。
IF  5.992  
高分杂志，完美要求吗？

farmer000

这种同种指标，阈值却不同的图片，怎么评价？编辑怎么通过的？
2.9分的杂志

niwanmao

farmer000 发表于 2016-6-25 21:13
这种同种指标，阈值却不同的图片，怎么评价？编辑怎么通过的？
2.9分的杂志
...

这些指标其实都是属于分群清楚的指标，可以直接在分界处设门。
第二篇比较真实，第一篇的第二行中间那个图确实存在过于靠左的问题，不过问题不是很大，所以在结果上还是存在正确的趋势，不影响最终结果，属于无伤大雅的。

yuanli

新手一枚，请问一下，一个流式图拿来，能从图上就看出电压和阈值么？从哪几方面分析判断做图的好坏呢？

niwanmao

yuanli 发表于 2016-6-30 09:36
新手一枚，请问一下，一个流式图拿来，能从图上就看出电压和阈值么？从哪几方面分析判断做图的好坏呢？ ...

看出电压和阈值？这个看不出来的，需要拿到原始FCS文件才能看出，因为这些设置包含在数据文件内。
判断做图的好坏，实际上应该说判断结果的质量，需要从细胞群的分布判断，但不同指标分析的方法不同，所以没有统一的标准。例如做淋巴细胞亚群，那么就得看CD3、CD4、CD8的分群好坏，补偿是否调节到位；如果做凋亡，就得看AV和PI两个指标的分群是否清楚，补偿是否调好；而做ROS，需要看FITC通道的荧光值变化趋势，补偿其次。所以实验，均需要尽可能用死活鉴别染料，排除死细胞，排除粘连体、碎片等干扰。

hbezyr

这是要搞事情啊。
阈值不是一切的标准啊。

bullfoo

不过说真的，文章1中的胞内因子的表达染得确实蛮好的，我IL-22一直染不好

hbezyr

bullfoo 发表于 2016-7-1 21:48
不过说真的，文章1中的胞内因子的表达染得确实蛮好的，我IL-22一直染不好

IL22的表达是membrane-bounded的。实在不行，你就试试表面染，会有意想不到的结果。