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[流式相关软件] 细胞周期应用

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发表于 2021-9-4 12:33:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星未解决
各位大神,请教大家一下问题:我同时做了3种细胞株,都是相同的病毒进行敲减后的NC和KD之间的比较;镜下看细胞状态都挺好,同时进行细胞固定,70%的酒精4℃固定24h,BD的550825试剂染色15分钟,用BD的C6 plus上机,上机速度控制在150个细胞/s;收集细胞;但是为什么有的细胞株就是不出峰呢?图还特别难看;求各位大神指教;

2021.09.04-.zip

9.48 MB, 下载次数: 18

组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
 楼主| 发表于 2021-9-4 12:45:25 | 显示全部楼层
之前做,那两个不出峰的细胞是可以拟合出图形的,虽然不太典型,这不知道是哪里出了问题,上传一下之前做的周期,大家帮我参谋一下,被这些问题快折磨的不行了

2021.07.16.zip

6.28 MB, 下载次数: 0

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发表于 2021-9-5 10:51:56 | 显示全部楼层
你用的是Accuri,Accuri的数据在modfit上分析是存在兼容性问题。

我这边用其它第三方软件,进行缩放后可见,是有明显的G2/M峰的,只是要将PE-A和PE-H放大。不过在拟合模型上,也有个别数据拟合不出,所以只能通过自己在直方图上设门分析比例了。 这里有个问题是,你的细胞是二倍体的还是多倍体的?PE-A和PE-H散点图右上方感觉有点像拖尾。

20210905_104729.jpg
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2021-9-14 20:47:35 | 显示全部楼层
倪老师你好,我的细胞是人的细胞,应该是2倍体的;我同期做了3个细胞株,每种细胞分别有2组;有2种细胞就是不出峰;有什么问题是导致细胞不出峰的呢?
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 楼主| 发表于 2021-9-14 20:48:07 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2021-9-5 10:51
你用的是Accuri,Accuri的数据在modfit上分析是存在兼容性问题。

我这边用其它第三方软件,进行缩放后可见 ...


倪老师你好,我的细胞是人的细胞,应该是2倍体的;我同期做了3个细胞株,每种细胞分别有2组;有2种细胞就是不出峰;有什么问题是导致细胞不出峰的呢?
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发表于 2021-9-15 07:54:23 | 显示全部楼层
THY 发表于 2021-9-14 20:48
倪老师你好,我的细胞是人的细胞,应该是2倍体的;我同期做了3个细胞株,每种细胞分别有2组;有2种细胞 ...

峰是有的,你仔细看我前面给你的图,只是这个染色有问题,因为第2个峰应该是G2/M峰,但其后面的拖尾太明显了。所以你后续需要在标本处理上再下功夫。
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发表于 2021-9-23 12:39:52 | 显示全部楼层
看了一下你的文件,你应该是在分析KS和U937细胞时遇到问题,其中KS是可以拟合的,只是KS在分析时可能选错了细胞群,导致无法拟合。U937的峰比较诡异中间多了一个峰,看着像是其他细胞污染了。楼主应该不太熟悉细胞周期分析,建议每次做一种细胞。
KS.png

画圈的是多出来的峰

画圈的是多出来的峰
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