Flowjo比较不同细胞数目的流式数据

18804313936

niwanmao 发表于 2021-3-17 20:05
绝对细胞数量，应该是采用绝对计数微球作为参比物，从而计算出细胞绝对数。不是获取数量要求一致。 ...

太感谢啦！不过这么说来的话，concentrate、Downsample这些功能还有什么意义呢？

niwanmao

18804313936 发表于 2022-8-13 18:42
太感谢啦！不过这么说来的话，concentrate、Downsample这些功能还有什么意义呢？ ...

Concatenate是为了将数据合并在一起，如果是相同样本可以增加细胞数量，如果是不同样本可以对比。

Downsample是为了减少细胞数量，便于降维运算（降维运算非常耗费内存，一般只能运算5000~10000左右）

liuruiluna

那顺便请教一下哦，叠加图的时候，归一化模式与对细胞数进行了“统计学上的统一”有关系没？

niwanmao

liuruiluna 发表于 2022-8-15 12:01
那顺便请教一下哦，叠加图的时候，归一化模式与对细胞数进行了“统计学上的统一”有关系没？ ...

叠加图的归一化，应该是比较简单的以某个荧光强度占总数的占比进行归一的。

liuruiluna

niwanmao 发表于 2022-8-15 12:20
叠加图的归一化，应该是比较简单的以某个荧光强度占总数的占比进行归一的。 ...

哦~~原来是这样，直方图的纵坐标 是细胞数量吧？ 感觉直方图的归一化是把纵轴拉到一样，所以感觉是把细胞数拉到一致

niwanmao

liuruiluna 发表于 2022-8-15 13:39
哦~~原来是这样，直方图的纵坐标 是细胞数量吧？ 感觉直方图的归一化是把纵轴拉到一样，所以感觉是把细胞 ...

都拉成百分比了。

liuruiluna

niwanmao 发表于 2022-8-15 13:52
都拉成百分比了。

懂了，那这种归一化是受认可的对吗，也就相当于解决了虽然细胞数不同，但是可以对百分比进行合理对比的问题吗？

niwanmao

liuruiluna 发表于 2022-8-15 13:55
懂了，那这种归一化是受认可的对吗，也就相当于解决了虽然细胞数不同，但是可以对百分比进行合理对比的问 ...

认可的。
就是纯粹为了让不同样本的图形更容易看出分布上的差异。