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楼主: xhxiejing

[标本处理] 关于GFP荧光自发降解问题

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 楼主| 发表于 2012-9-13 17:40:33 | 显示全部楼层

我的目的蛋白是和GFP偶联的,他们在细胞内收到药物刺激时,目的蛋白被降解,与之相偶联的GFP蛋白也因此降解,这样荧光强度的下降就能指示我的目的蛋白的量了。我整理一下图,上图哈
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 楼主| 发表于 2012-9-13 17:43:31 | 显示全部楼层
gcz5340 发表于 2012-9-12 22:33
你说的荧光强度下降是指mean值吗,百分比有变化吗,重复几次都这样吗,能否上图看一下?一般来说GFP是很稳 ...

我是看mean值,这个问题基本在我每次实验中都会发现。百分比,您是说带有荧光的细胞占总细胞数吗,因为我稳转细胞阳性率几乎百分之百,所以就没有看百分比了。
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 楼主| 发表于 2012-9-13 18:41:20 | 显示全部楼层
gcz5340 发表于 2012-9-12 22:33
你说的荧光强度下降是指mean值吗,百分比有变化吗,重复几次都这样吗,能否上图看一下?一般来说GFP是很稳 ...

这是我选了两个图,一个是我在避光,插冰上的条件下,另一个是不避光,室温条件下。还请老师帮忙分析下,谢谢啦。

避光,冰上,FM1,FM2为完全培基培养的我的稳转细胞,两个样完全一样,只是FM1先测,FM2二十分钟后测。FM1 ...

避光,冰上,FM1,FM2为完全培基培养的我的稳转细胞,两个样完全一样,只是FM1先测,FM2二十分钟后测。FM1 ...

不避光,室温条件下,1,2,3三个样都一样,每个样之间隔五六分钟,1号样的mean值是228,2号的mean值是203,3号 ...

不避光,室温条件下,1,2,3三个样都一样,每个样之间隔五六分钟,1号样的mean值是228,2号的mean值是203,3号 ...
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 楼主| 发表于 2012-9-13 18:48:16 | 显示全部楼层
第一个图中,FM1的mean值是247,FM2的mean值下降为210. 第二个图中,none1 的mean值为228,5分钟后测得none2 的mean值为203,几分钟后再测none3,mean值下降为187
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发表于 2012-9-13 20:36:50 | 显示全部楼层
我以前做细胞免疫荧光的时候用冰冻甲醇固定过GFP,可以试试看。甲醇装到小瓶子,头一天放到-20C。
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发表于 2012-9-13 21:43:35 | 显示全部楼层
xhxiejing 发表于 2012-9-13 18:48
第一个图中,FM1的mean值是247,FM2的mean值下降为210. 第二个图中,none1 的mean值为228,5分钟后测得none2 ...

看来像@mybbff 站友所说,你的标本看来是得固定,你可以多聚甲醛和冰甲醇都试试。
冰甲醇据我读到的资料可能对细胞形态影响比较大,不过由于你是细胞株,只有一种细胞,无所谓
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 楼主| 发表于 2012-9-13 22:31:03 | 显示全部楼层
mybbff 发表于 2012-9-13 20:36
我以前做细胞免疫荧光的时候用冰冻甲醇固定过GFP,可以试试看。甲醇装到小瓶子,头一天放到-20C。 ...

谢谢您的建议,那再请问,上机时是直接用冰冻甲醇来重选细胞吗,还是加成多少浓度的甲醇呢?
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发表于 2012-9-13 22:33:07 | 显示全部楼层
我没用这个办法做过FACS,制作过细胞免疫荧光。甲醇是百分百的。
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发表于 2012-9-13 23:20:09 | 显示全部楼层
还是没想到你这个是什么原因,但是从你的图中看,不知道你为什么FSC和SSC会选log呢,圈的群体也很怪,另外你的GFP图中population有没选择G1,看你第一个FSC/SSC图中黑点掺着红点,对于细胞株的话应该如下图:

还是觉得固定没有什么用处,固定只是把蛋白交联在固定的位置,如果有楼主所说的降解情况,还是没办法避免,不可确实可以试一下。

Untitled.png
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发表于 2012-9-14 10:56:45 | 显示全部楼层
gcz5340 发表于 2012-9-13 23:20
还是没想到你这个是什么原因,但是从你的图中看,不知道你为什么FSC和SSC会选log呢,圈的群体也很怪,另外 ...

@xhxiejing 用的是FCS Express,是不是显示的问题?而不是没圈中那群细胞?

我还是之前那个看法,应该不是降解,而是漏出去,所以固定可以试试 @xhxiejing  
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