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[流式相关软件] 请问如何做PE/FITC ratio的直方图

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发表于 2022-3-12 12:33:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏5流星已解决
如文献中所示,横坐标为PE/FITC ratio的直方图该怎么做呢?我在网上和流式技术支持那里都没找到解决方法,还请老师指教,谢谢!

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左侧那种,Flowjo里面可衍生出新的参数,将该参数计算公式定为PE MFI/ FITC MFI,即可绘制该参数的直方图,就是这样子的。
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发表于 2022-3-12 12:33:17 | 显示全部楼层
woodylock 发表于 2022-3-14 13:32
谢谢老师,这样可以统计出柱状图,但文献左图那种像是在流式直接做出的,我感觉是BD Diva里有ratio功能, ...

左侧那种,Flowjo里面可衍生出新的参数,将该参数计算公式定为PE  MFI/ FITC MFI,即可绘制该参数的直方图,就是这样子的。
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 楼主| 发表于 2022-3-12 12:36:38 | 显示全部楼层
文献图请见附件
1.png
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发表于 2022-3-12 19:53:20 | 显示全部楼层
不知道你这里指的是什么指标。从字面意思看,应该是直接将PE的MFI除以FITC 的MFI,除出来的得数,在统计学软件(如GraphPad Prism)里面绘制直方图
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 楼主| 发表于 2022-3-13 21:51:30 | 显示全部楼层
谢谢老师回复!这是检测过氧化脂质的染料,它的还原形式在PE发光,被氧化后在FITC发光。我看染料说明书也给的是red/green ratio。我还想请教一下老师,如何用graphpad做这种双通道比值的直方图呢?
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 楼主| 发表于 2022-3-14 10:49:26 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2022-3-12 19:53
不知道你这里指的是什么指标。从字面意思看,应该是直接将PE的MFI除以FITC 的MFI,除出来的得数,在统计学 ...

谢谢老师回复!这是检测过氧化脂质的染料,它的还原形式在PE发光,被氧化后在FITC发光。我看染料说明书也给的是red/green ratio。我还想请教一下老师,如何用graphpad做这种双通道比值的直方图呢?
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发表于 2022-3-14 13:24:00 | 显示全部楼层
woodylock 发表于 2022-3-14 10:49
谢谢老师回复!这是检测过氧化脂质的染料,它的还原形式在PE发光,被氧化后在FITC发光。我看染料说明书也 ...

大致步骤是这样的:
1、在流式上,分别在流式图的统计信息那里,找到FITC的MFI和PE的MFI,记在Excel上,前面加一列标本编号,后面加一列比值,然后录入公式计算FITC MFI和PE MFI之间的比值。
2、将Excel数据导入或复制粘贴到GraphPad Prism里面,按比值,绘制统计图,即可有柱形和误差线出来。
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 楼主| 发表于 2022-3-14 13:32:33 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2022-3-14 13:24
大致步骤是这样的:
1、在流式上,分别在流式图的统计信息那里,找到FITC的MFI和PE的MFI,记在Excel上, ...

谢谢老师,这样可以统计出柱状图,但文献左图那种像是在流式直接做出的,我感觉是BD Diva里有ratio功能,但我没有研究出来,我先统计MFI看看结果,再次谢谢老师回复!
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 楼主| 发表于 2022-3-14 20:10:59 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2022-3-14 13:38
左侧那种,Flowjo里面可衍生出新的参数,将该参数计算公式定为PE  MFI/ FITC MFI,即可绘制该参数的直方 ...

多亏老师指导,我终于知道左侧图怎么做出来了。原来是在flowjo→tools→derive parameters里改变参数轴。
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