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核酸检测参考文献

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发表于 2011-10-12 09:49:02 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 liyouzzz_000 于 2011-10-12 09:54 编辑

2005-NAR-PCR amplification from single DNA__ molecules on magnetic beads in emul.pdf (504.61 KB, 下载次数: 18) 2003-beaming-Transforming single DNA molecules into fluorescent.pdf (631.71 KB, 下载次数: 17) 2006-BEAMing up for detection and quantification of rare sequence variants.pdf (235.39 KB, 下载次数: 17) 几篇关于关于核酸的beads用流式检测的文献

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 楼主| 发表于 2011-10-12 09:57:28 | 显示全部楼层
不知道为什么有的传不上去。
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发表于 2011-10-12 10:11:55 | 显示全部楼层
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发表于 2011-10-14 08:55:07 | 显示全部楼层
liyouzzz_000 发表于 2011-10-12 09:49
几篇关于关于核酸的beads用流式检测的文献

大致浏览了下,看得不是很懂,可能是因为以前PCR没学过的缘故,呵呵。
有几个疑问:
1、这个应用似乎挺费时的,在PCR的基础上又增加了磁珠结合、流式检测,跟直接PCR相比有什么优势?
2、你们平时应用在哪些方面?
3、步骤中的第一步需要在磁珠表面结合寡核苷酸,这些寡核苷酸是随便买的到的还是需要专门设计序列的?
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 楼主| 发表于 2011-10-14 12:22:45 | 显示全部楼层
回复 niwanmao 的帖子

我也是才接触,以前是师姐在做。
1.微乳相PCR可以形成一个个独立隔间,主要目的是进行单分子的扩增,然后将每个磁珠上具有来源于一个模板的指数扩增产物,这样有利于检测一些类似微突变等微量的检测,灵敏度较高。总体感觉比较费时费力。普通的PCR扩增会产生扩增歧视性,有可能检测不到突变等。而且流式是作为一种检测方法,这样可以方便分析单个独立的beads,也利于统计。
2.平时应用,主要是一些检测疾病相关的基因突变,尤其是肿瘤的早期诊断等。
3.序列就是需要扩增的特异性引物,再加上带上一段linker,5'端用生物素标记,生物素可以与beads上的链亲和素共价结合而接到beads上。序列是设计的,一般的公司都可以合成。
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发表于 2011-10-14 16:32:16 | 显示全部楼层
进行Luminex 培训时听过他们说过这样的技术,应该可以进行高通量检测,就是不知道成本如何?
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发表于 2011-10-14 17:02:30 | 显示全部楼层
liyouzzz_000 发表于 2011-10-14 12:22
回复 niwanmao 的帖子

我也是才接触,以前是师姐在做。

读这个文献特别费劲,主要是里面很多内容都是有关PCR扩增的,这是我的弱项。

能不能大致给我解释一下大概的步骤?
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 楼主| 发表于 2011-10-14 19:42:20 | 显示全部楼层
回复 haven_t 的帖子

个人觉得成本较高。是可以用于高通量,如果能应用起来的话,高通量成本也就低了。
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 楼主| 发表于 2011-10-14 19:50:06 | 显示全部楼层
回复 niwanmao 的帖子

http://115.com/file/e65xgjvi#
2006-BEAMing_protocol-NatMeth.pdf

这篇是关于beaming的具体操作过程,很详细的~~:)
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发表于 2011-10-17 11:13:38 | 显示全部楼层
liyouzzz_000 发表于 2011-10-14 19:50
回复 niwanmao 的帖子

http://115.com/file/e65xgjvi#

看了下,看来只能用在一些已知基因突变的领域。不知道我理解的对不对?
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