技术进展

1744 niwanmao 管理组

在过去二十年,流式细胞术(FC)免疫分型已发展成为血液肿瘤诊断、预后评估和疾病监测不可或缺的工具。 流式细胞仪硬件上的进展,使得我们现在可以检测越来越多的荧光,可以快速评估每秒数千个细胞的多个特征,从而为鉴别正常和低比例肿瘤细胞提供了越来越有利的条件,并且可评估不同细胞谱系的分化和成熟模式。
然而,数据分析的手段却落后于流式细胞仪进展的速度。目前的数据分析软件都只能最多呈现二维散点图,那么p个参数所需要的二维散点图的总数为[px(p-1)/2],也就是说一个常规10色流式在即使不设门,可生成66个初始二维散点图,并且这个数量随着设门数增加而急剧增加。二维散点图提供的信息很有限,使得不同参数之间的信息分离,要获得细胞的完整表型信息,需要同时看完所有的散点图并且记住他们的表型关系。我深刻地记得,当时从4色流式一下子转换到10色流式,在数据分析上备受煎熬,一个病例有时候可以分析一整天。
在2017年3月3日的Cytometry B杂志上,Jafari K等人发表了一篇有趣的文章《Visualization ofcell composition and maturation in the bone marrow using 10-color flow cytometry and radar plots》,这篇文章倒也不是介绍什么颠覆性的分析方法,依然需要事先用二维散点图逐级设门圈出目的细胞,但是他们利用了Kaluza软件里面的雷达图呈现8维散点图,从8~9维方式显示了细胞分化成熟轨迹的分析,比较方便地肉眼区分正常人和MDS患者的骨髓,大家可参考一下。
方案
三管10色,见下表:

Fig1.png  (2017-3-6 21:00 上传)

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各管可区分的细胞、表型及其在雷达图上的颜色

Fig2.png  (2017-3-6 21:01 上传)

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正餐:分析
首先还是需要进行二维设门,圈出各类细胞。

Fig3.png  (2017-3-6 21:01 上传)

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第一步是三管共同设门需要的4个门:


管1的设门:

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管2的设门:

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管3的设门:

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正常人骨髓的管1、管2和管3的雷达图呈现,观察红系、粒系、单核系的分化。

Fig7.png  (2017-3-6 21:02 上传)

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三例反应性骨髓增生的骨髓管1雷达图呈现,可见各系分化轨迹均无明显异常。

Fig8.png  (2017-3-6 21:02 上传)

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那么MDS会怎样?和正常人骨髓一对比,就很容易看出问题。
正常人的骨髓:

Fig9.png  (2017-3-6 21:02 上传)

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低原始细胞数的MDS患者骨髓:

Fig10.png  (2017-3-6 21:02 上传)

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应该说,雷达图对于多维参数的同时呈现比较有利,但是可能很多人看着容易乱,没关系,我也是:)但毕竟,这是一个有趣的试验。




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有 1 条回复

2楼 saureus LV2

太酷了!!!!!!!!!!!!!