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[流式相关软件] 细胞周期拟合的问题

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发表于 2020-2-28 19:23:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏3流星已解决
图1-4是我圈门的过程,细胞是肿瘤细胞,对照组未给任何处理。在用flowjo拟合后生成了图3,但是S期是负值,且G1和G2的CV值太大,于是我调整了G2期,有了图4,这样S期和CV值都正常了。想问下大家两个问题:
1.把红色拟合线调到和黑色实际的拟合线最大程度重叠,这样做正确吗?还是说会导致数据不可信?
2.手动调整G2期宽度和峰值位置这样做正确吗?
不知道大家拿到软件生成的拟合曲线是怎么处理的,做过的大神们求指教~~

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4的结果是对的。 可以手动调,但是不是随便乱调,一个是综合RMS和各期的CV,第二个是根据已知倍体位置。
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发表于 2020-2-28 19:23:48 | 显示全部楼层
4的结果是对的。
可以手动调,但是不是随便乱调,一个是综合RMS和各期的CV,第二个是根据已知倍体位置。
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 楼主| 发表于 2020-3-1 09:56:29 | 显示全部楼层
本帖最后由 cocoa 于 2020-3-1 10:04 编辑
niwanmao 发表于 2020-2-29 12:55
4的结果是对的。
可以手动调,但是不是随便乱调,一个是综合RMS和各期的CV,第二个是根据已知倍体位置。 ...

谢谢老师的回复,就是我同一组细胞,给药了之后周期图整体向右侧偏移了。。这个不知道是什么原因?细胞系一致的情况下会偏移这么多吗?我的Hoechst染料都是统一加的,应该不是染料不均一的原因~

左图为对照组,右图是同一种细胞给药物处理

左图为对照组,右图是同一种细胞给药物处理
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发表于 2020-3-1 10:46:12 | 显示全部楼层
cocoa 发表于 2020-3-1 09:56
谢谢老师的回复,就是我同一组细胞,给药了之后周期图整体向右侧偏移了。。这个不知道是什么原因?细胞系 ...

怪标本,就不对了。
还是你染色的问题,染色的时候,染料和细胞的比例没有调整到一致,所以造成这样的偏移。
但这个偏移并不影响你的分析,如果你确认没有异倍体存在,就只需移动G1和G2的峰位置标识即可。
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 楼主| 发表于 2020-3-1 14:24:31 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2020-3-1 10:46
怪标本,就不对了。
还是你染色的问题,染色的时候,染料和细胞的比例没有调整到一致,所以造成这样的偏 ...

明白了,感谢老师的回复
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