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推荐一个多色补偿矩阵自动生成工具-AutoSpill

发布者: niwanmao | 发布时间: 2021-5-27 16:42| 查看数: 462| 评论数: 0|帖子模式

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AutoSpill是一种对流式数据自动生成补偿矩阵的新颖方法。 AutoSpill结合了细胞群自动识别、基于线性回归的初始补偿矩阵计算和迭代优化以减少误差的功能,最终可产生了一个近乎完美的补偿矩阵,从而可以生成更高质量的数据。

AutoSpill也是使用单色补偿对照,与通用的下游流式细胞仪软件兼容,但是与当前可用的自动调节补偿方法在两个关键方面不同:
(1)对照的制备要求不高,因为它不需要存在分群非常好的阳性和阴性群体。
(2)不需要手动调整补偿矩阵。
(3)如果在数据集中存在空白通道,则可以计算并去除样品中的自发荧光。
2021-05-27_16-41-48.jpg

使用说明:
1、访问https://autospill.vib.be/public/#/run
2、点击“Calculate Compensation”按钮,然后点击Browse,上传单染补偿FCS文件,可多个一起上传,最多100个文件,每个文件最大可50MB,然后提交
3、定义补偿参数:AutoSpill将自动检测并分配参数,但是可以修改这些参数。对于您添加的每个.fcs文件,确保已为其分配了正确的染料。
4、提交作业进行处理。这个过程可能会需要点时间,你可以记住Job ID,然后后续可回来根据Job ID查找运算结果。
5、在“Results”页面上,手动检查Gate和Spillover图。如果发现错误,则可以使用“re-adjust parameters”选项手动覆盖自动选择,例如细胞群选择。
6、完成后,将溢出矩阵下载为.mtx文件(可导入到FlowJo中)或下载为.csv文件(可导入到其他平台中)。

注:由于服务器是国外的,所以有时候可能需要翻出去。

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