平衡的免疫系统是健康的本质。研究免疫，大多是从动物模型开始，但是将我们从动物模型得到的基础免疫学知识转化到人类身上，一直是一项重大挑战，失败比成功多得多。为了提高对人类免疫系统的了解，免疫学家现在正在寻找不同的方法来直接研究人类的免疫状况。故迫切需要新的研究策略，最有前途的策略之一改编自系统生物学，被称为系统免疫学。通常，系统生物学方法试图识别给定系统的主要组件，并测量这些组件如何响应系统的扰动而变化。在免疫系统中，主要成分是不同类型的免疫细胞及其与之通信的细胞因子，庆幸的是，这些成分中的大多数都存在于血液中，并可以使用可用的技术进行测量。

各种各样的因素都可能干扰人类的免疫系统，系统免疫学研究的是对标准疫苗的反应，例如流感病毒疫苗、黄热病疫苗。系统疫苗学可以揭示免疫系统的哪些成分发生变化，以及它们如何响应干扰而发生变化，这反过来又可以提供有关给定人员免疫系统的敏感性以及个体之间免疫应答变化的信息。该信息可以预测对疫苗的反应性或无反应性。这对于诸如流感疫苗之类的较弱的疫苗来说是一个重要的问题，尤其是当对年幼或年长的个体接种时。

免疫系统的变异，主要表现在以下几方面。