找回密码
 加入流式中文网

QQ登录

只需一步,快速开始

流式中文网 门户 查看主题

设计多色方案如何给不同分子分配荧光素?标准步骤在此

发布者: niwanmao | 发布时间: 2022-1-3 21:46| 查看数: 642| 评论数: 0|帖子模式

亲爱的FLOWER,加入流式中文网,一起讨论,一起学习,享受更多福利吧!

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?加入流式中文网

×
在设计多色流式方案时,会设计到给A抗原分配什么荧光素?B抗原分配什么荧光素?以前4色,还是比较好选,现在10色、20色、30色,可就头疼了,选错了,弱表达的抗原跑不出来,或者荧光渗漏过大导致补偿调不好,或者Spreading Error(扩散误差)过大导致鱼尾状分布,很难设门,不好看甚至结果可能不准确。

所以,要设计一个合理的多色方案,不是一件容易的事,但是我们还是有标准的步骤的,大家只要按照此步骤,问题不大,建议测试时选择小包装的产品,测试步骤完成后,再订购大包装的抗体。

步骤
1. 根据实验目的,给目标细胞群(例如CD8+T细胞)定义表达特点。

2. 列出分析目标群体所必需的谱系标记(例如分析CD8+T细胞,至少需要CD3、CD8和CD45)。

3. 列出所有感兴趣的目标标记,并将预期的表达模式和抗原密度分类为低、中和高表达(如果已知的话)。

4. 订购试用装或小包装抗体,做各个荧光染料的单染对照(可用确认表达该标记的细胞,也可用荧光补偿微球),在机器上跑完之后,在FlowJo或其他流式分析软件中计算SSM(溢出扩散矩阵)。

例如下图就是一个22 色实验的SSM示例,大家平时也可作为大致的参考(点击图片放大查看高清版本):
20220103_212620.png

5. 在SSM中,寻找三个最大值,将这三个通道相应的荧光染料分配给互斥的抗原,即不在同一细胞上表达的抗原。例如在上面的SSM中,最大值是BUV563渗漏到YG-586 PE检测器(22.3)。

6. 计算SSM中的**行**总和。行总和的荧光素,扩散误差最小,这种荧光素应该分配给谱系标记,例如本次试验靶细胞所需的谱系标记CD3和CD8,用于准确圈中靶细胞且不会对其它通道造成较大影响。在上面示例的SSM中,扩散误差最小的荧光素是BV421 和 BUV395。

7. 计算SSM中的**列**总和。

列总和最小的检测器接收到的扩散误差最少,所以这些检测器适用于弱表达或未知表达的目标标记。在上面示例的SSM中,最不容易被影响的检测器是B-515 和 V-510 检测器。当然,如果有可能,尽量给这些目标抗原分配较亮的荧光染料。        

列总和最大的检测器会接收更多的扩散误差,如上面示例SSM中,的YG586 和 YG-610 检测器。不过,也需要注意,如果只是其中一种荧光素导致该检测器扩散误差过大,例如示例SSM中的BUV563 对 YG-586 检测器的贡献,如果该荧光素不用,那么YG-586检测器还是相当不错的。

8. 按照上面的方法确定下最终的荧光素搭配方案之后,订购大包装,开始做包括所有相关FMO对照的正式实验。


信源:Cossarizza A, Chang HD, Radbruch A, et al. Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (third edition). Eur J Immunol. 2021;51(12):2708-3145. doi:10.1002/eji.202170126

最新评论

手机版|流式中文网 ( 浙ICP备17054466号-2|浙ICP备17054466号-2 )

浙公网安备 33038202004217号

GMT+8, 2024-4-16 20:00

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表