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[其它] 流式测细胞脂质过氧化的结果如何表现成Ratios of PE/FITC?

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发表于 2022-8-10 11:08:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
请问各位大佬,用abcam家的ab243377Lipid PeroxidationAssay Kit (Cell-based),通过流式测细胞的脂质过氧化,结果是怎么表现为ratios of red (PE)/green(FITC) fluorescence intensities的呢?(见说明书中的Figure2及图片1), 用Flowjo能做到吗?另外,参考文献中也有这种表现形式,(见图片2)希望大佬能指点一二,多谢!下面链接是试剂说明书,附件是参考文献abcam脂质过氧化试剂盒说明书
图片1.png
图片2.png

CD36-mediated ferroptosis dampens intratumoral CD8 T cell effector function and.pdf

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最佳答案

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做比例,需要用flowjo里面有个derived parameter,参见教程: https://docs.flowjo.com/flowjo/experiment-based-platforms/plat-derived-overview/
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发表于 2022-8-10 11:08:06 | 显示全部楼层
nikeyia10 发表于 2022-8-10 15:36
谢谢站友帮忙,您回答了另外一个问题(纵轴显示% of Max),多谢多谢!我又看了看,觉得横坐 ...

做比例,需要用flowjo里面有个derived parameter,参见教程:
https://docs.flowjo.com/flowjo/e ... t-derived-overview/
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发表于 2022-8-10 11:19:36 | 显示全部楼层
图2就是flowjo做的呀 你在folwjo的layout界面可以进行两个流式图的叠加。
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 楼主| 发表于 2022-8-10 11:27:24 | 显示全部楼层
srfts 发表于 2022-8-10 11:19
图2就是flowjo做的呀 你在folwjo的layout界面可以进行两个流式图的叠加。

谢谢您,但是叠加后的横坐标不是比值呀,图片3是我找了个数据叠加后的
图片3.png
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发表于 2022-8-10 13:22:02 | 显示全部楼层
你先给阴性圈门 然后叠加之后会显示阳性率 横坐标那个看起来是抹掉了坐标 后面又加的文字
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发表于 2022-8-10 13:28:44 | 显示全部楼层
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 楼主| 发表于 2022-8-10 15:36:38 | 显示全部楼层
srfts 发表于 2022-8-10 13:28
sry 翻到了帖子有解答 https://www.flowcyto.cn/bbs/forum.php?mod=viewthread&tid=9719&highlight=%E5%8F% ...

谢谢站友帮忙,您回答了另外一个问题(纵轴显示% of Max),多谢多谢!我又看了看,觉得横坐标应该没有那么简单,这里涉及两种荧光的转换,从PE到FITC,但是这个比率做成这样的直方图让人很费解
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 楼主| 发表于 2022-8-12 09:27:51 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2022-8-10 19:09
做比例,需要用flowjo里面有个derived parameter,参见教程:
https://docs.flowjo.com/flowjo/experimen ...

谢谢倪老师!破解版的flowjo好像没办法加
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发表于 2022-8-12 09:52:38 | 显示全部楼层
nikeyia10 发表于 2022-8-12 09:27
谢谢倪老师!破解版的flowjo好像没办法加

应该有的吧。

首页上的免费流式分析软件FCSAlyzer 0.9.22α版(https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-9335-1-1.html),是可以添加derived parameter的:
截屏2022-08-12 09.49.33.png
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 楼主| 发表于 2022-8-12 17:11:39 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2022-8-12 09:52
应该有的吧。

首页上的免费流式分析软件FCSAlyzer 0.9.22α版(https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-933 ...

倪老师有这个软件的使用手册吗?
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