小鼠treg 流式数据分析

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大神们，求助，foxp3， af700，单染很明显（中间图），样品（左1）和空白管（右1）对照也很明显，但是分析后就看不到明显分群了，是不是分析有问题条补偿问题：


补偿单阳管都很好，FMO就如下：

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抱歉， 图片没有上传上去

niwanmao

Treg的SSC有这么大？ 单染管是不是假阳？

建议：
1、每个标记，都把CD分子名称写上，否则我们在回答时看坐标很累，不知道哪个荧光素对应哪个CD分子。而且你这样的数据去发文章，很容易受到Reviewer质疑的，因为每个通道都没写CD分子名称，这是大忌。
2、设门分析，建议先圈CD3+CD4+，再分析CD25+foxP3+，这样的分析设门才是正确的，而不是单标分析

wxd

根据你的描述和放的图片，问题可能出在抗体选择或者圈门策略上。你可以详细描述一下你的实验设计以及圈门策略。

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niwanmao 发表于 2024-1-3 09:10
Treg的SSC有这么大？ 单染管是不是假阳？

建议：

倪老师，我是按CD45——apc，CD3——percp5.5，CD4——fitc， foxP3——af700分析来的，结果就如图一了，然后怀疑foxP3没染上，看了一下单染管，和样本管对比，发现SSC确实很大，是不是一些大细胞里面也有foxP3，T细胞里面的却没有染上，我没有做CD25+。

914776358

wxd 发表于 2024-1-3 09:18
根据你的描述和放的图片，问题可能出在抗体选择或者圈门策略上。你可以详细描述一下你的实验设计以及圈门策 ...

你好，我是按CD45——apc，CD3——percp5.5，CD4——fitc， foxP3——af700分析来的，结果就如图一了，然后怀疑foxP3没染上，看了一下单染，发现SSC很大，觉得有问题，样本和空白一对照，那个离群的飘起来的就很离谱

niwanmao

914776358 发表于 2024-1-3 10:51
你好，我是按CD45——apc，CD3——percp5.5，CD4——fitc， foxP3——af700分析来的，结果就如图一了，然 ...

首先，淋巴细胞肯定是小的，如果全部都出现在大细胞区域，这些信号就有问题