细胞周期ModFit分析

vetzcm · 发表于 2012-3-22 23:30:30

最近自己用ModFit分析细胞周期，现将一些图片贴上来，想请大家看看我分析的有问题吗？R1，R2自己圈的细胞，设定软件Auto分析，总心里觉得结果不靠谱...谢谢大家！

这是正常细胞的。

给药细胞的如下：

5

stef1981 · 发表于 2012-3-23 09:03:13

R1的圈法是对的，R2不对，应该排除聚集细胞，参数应该用FL2W-FL2A

niwanmao · 发表于 2012-3-23 09:12:50

stef1981 发表于 2012-3-23 09:03

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R1的圈法是对的，R2不对，应该排除聚集细胞，参数应该用FL2W-FL2A

正解，也可以用斜向的平行四边形，最关键是只圈左边那堆。

vetzcm的这个W/A图虽然分群不太清楚，但还是可以圈出左边那堆的，例如第一个图R2旁边的绿色和蓝色、黄色这个竖向的矩形分布。

vetzcm · 发表于 2012-3-23 18:30:50

stef1981 发表于 2012-3-23 09:03

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R1的圈法是对的，R2不对，应该排除聚集细胞，参数应该用FL2W-FL2A

我们的机器FL2W-FL2A可能对应于PE-W 和PE-A 这个和我图中的通道应该一致的

vetzcm · 发表于 2012-3-23 18:39:30

niwanmao 发表于 2012-3-23 09:12

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正解，也可以用斜向的平行四边形，最关键是只圈左边那堆。

vetzcm的这个W/A图虽然分群不太清楚，但还是 ...

谢谢老师指点！我想请教下老师，我处理的细胞分群不明显，是不是由于消化时不充分，不同数目的粘连细胞造成的呢？感觉用HepG2做实验，细胞处理上流式结果不如Hela细胞好，Hela处理后很容易形成单细胞悬液，而HepG2细胞消化后在显微镜下观察就见有2,3，4,5，甚至6个cells连在一起的团块，上机用400目纱布过滤上机，细胞的分群特征也不是很理想。我主要用HepG2来做凋亡和周期实验，每次操作总担心消化过度，引起假阳性，不知如何把握好这个度...

niwanmao · 发表于 2012-3-23 20:54:43

vetzcm 发表于 2012-03-23 18:30:50

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[quote]stef1981 发表于 2012-3-23 09:03 [url=forum.php?mod=redirect&go

是的，标记名称无所谓的。

niwanmao · 发表于 2012-3-23 21:01:42

vetzcm 发表于 2012-03-23 18:39:30

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[quote]niwanmao 发表于 2012-3-23 09:12 [url=forum.php?mod=redirect&go

我感觉乙醇固定这一步的手法比较重要，边滴边震荡，可以是把细胞滴到乙醇，也可以把乙醇滴到细胞悬液。你可以试试哪种对你更适合。

ddn111 · 发表于 2012-3-26 22:04:36

看你的图中，Ｇ２/Ｇ１用2.0有点不合适，拟合不好的话ＲＣＳ比较高！

vetzcm · 发表于 2012-3-26 22:11:33

ddn111 发表于 2012-3-26 22:04

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看你的图中，Ｇ２/Ｇ１用2.0有点不合适，拟合不好的话ＲＣＳ比较高！

我这个是用软件自动分析功能分析的自己手动分析，做的所有样品的RCS值都偏大，显示poor，怀疑自己处理细胞的问题较大还有，你说我要是收集40000，甚至50000个细胞用于分析是不是会好些呢？有这个必要吗呵呵，我又瞎想了

ddn111 · 发表于 2012-3-26 22:18:24

本帖最后由 ddn111 于 2012-3-26 22:19 编辑

找数据搞上来吧！:)设定左边那一条单个细胞门，收10000就行了！

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