查看: 24630|回复: 12
收起左侧

使用免费流式软件flowing实现漂亮的直方图叠加

  [复制链接]
发表于 2013-6-7 13:42:46 | 显示全部楼层 |阅读模式

亲爱的FLOWER,加入流式中文网,一起讨论,一起学习,享受更多福利吧!

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?加入流式中文网

x
在站内藏经阁的流式专业软件下载专帖(已通过实名认证和工作单位认证站友专用):http://www.flowcyto.cn/bbs/forum ... ptid=1664&pid=11275,我们将国外一款免费、新颖的流式分析软件flowing打包给大家(原来的安装模式不利于携带)。现将其中大家需求最大的直方图叠加功能介绍一下。

操作顺序如下图的1、2、3、4、5进行。
1、用快捷键Ctrl+D或菜单Create->visualization tools->Dot Plot绘制一个点图,然后选择该点图,按Ctrl+O或菜单File->Open FCS打开一个文件,设门。
2、用快捷键Ctrl+H或菜单Create->visualization tools->Histogram绘制一个直方图,点击第1个图,将图形下方的红块拖到直方图上,就实现了连接,然后右键Show population,将直方图的门设为R-1。
3、菜单Create->visualization tools->Overlay Histogram绘制一个叠加直方图,点击直方图2,将图形下方的红块拖到叠加直方图,此时的直方图2就是主直方图。
4、按照1同样的方式打开另一个要叠加的文件。
5、同样画出R-2的直方图5。
最后,选择直方图5,将下方的红块拖放到叠加直方图3,就实现与直方图2的叠加。
初始,直方图2和5均没有颜色,可通过右下方的属性窗口进行填充色、线条色的设置,如需设置填充色,需将Histrogram_filled设置为true。
解释1:新手可能不了解其中的灰色箭头(中间有个方块)是干什么用的,这个是flowing软件的新颖之处,它用箭头来代表你分析的流向,代表图形之间的关系。看了这些箭头,我下面这幅图的分析流程你就一清二楚了。

flowing直方图叠加

flowing直方图叠加


官网上也有相应的视频可下载:http://www.flowingsoftware.com/
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2013-6-11 13:14:19 | 显示全部楼层
flowing的功能确实蛮强大的,但是有几个小缺陷,不能做斑马线图,不能进行双指数转换(不知道是不是我没有找到)
如果这两点有了,基本上能逆转flowjo和FCS express的一统天下了
Elabscience® 您身边的流式专家,提供免费配色、数据分析,为您提供整体流式解决方案
 楼主| 发表于 2013-6-11 13:46:37 | 显示全部楼层

contour不是很重要吧?双指数转换@haven_t  站友的CFCS可以
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2013-6-11 22:22:39 | 显示全部楼层
本帖最后由 haven_t 于 2013-6-11 22:26 编辑
dragonhzqsmmu 发表于 2013-6-11 13:14
flowing的功能确实蛮强大的,但是有几个小缺陷,不能做斑马线图,不能进行双指数转换(不知道是不是我没有 ...


作为免费软件的确是很优秀,但是还是不能和flowjo等商业软件比,矩形门、椭圆门、散点图叠加、电子表格形式导出数据等等很多实用的功能都没有。我用Flowing分析过淋巴细胞亚群和白血病的数据,发现分析一两个数据不觉得,分析20个以上的数据会感觉到吃力,不过可能与分析习惯有关。
Elabscience® 您身边的流式专家,提供免费配色、数据分析,为您提供整体流式解决方案
 楼主| 发表于 2013-6-11 22:41:30 | 显示全部楼层
haven_t 发表于 2013-6-11 22:22
作为免费软件的确是很优秀,但是还是不能和flowjo等商业软件比,矩形门、椭圆门、散点图叠加、电子表格形 ...

确实存在一些缺陷,例如图形绘制不方便、图形样式太少,此外数据显示速度比CFCS慢一大截,看来C语言的优势还是很大的。
Elabscience® 您身边的流式专家,提供免费配色、数据分析,为您提供整体流式解决方案
发表于 2013-6-13 10:02:41 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-6-11 22:41
确实存在一些缺陷,例如图形绘制不方便、图形样式太少,此外数据显示速度比CFCS慢一大截,看来C语言的优 ...

数据显示速度其实不是太重要,大家不会太在意的。绘图要分两步做确实不太方便。关联的线条在进行数据分析演示的时候非常有用,不过在关系较多的时候排版就要麻烦一点,不能用紧凑的排版方式,否则线条被其它Item遮挡。
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2014-2-25 23:10:31 | 显示全部楼层
数据量很大时,就喜欢它的Folder Running功能
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2014-10-14 16:13:29 | 显示全部楼层
这个软件的关联功能比较强大,但是不能进行指数转换
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2015-3-2 15:37:15 | 显示全部楼层
请问,这个小软件可以调节补偿吗?post compensation?
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
 楼主| 发表于 2015-3-2 16:28:12 | 显示全部楼层
bingxuesong 发表于 2015-3-2 15:37
请问,这个小软件可以调节补偿吗?post compensation?

可以,具体操作见视频:http://services.btk.fi/cic/flowi ... ostcompensation.wmv
Elabscience® 您身边的流式专家,提供免费配色、数据分析,为您提供整体流式解决方案
您需要登录后才可以回帖 登录 | 加入流式中文网

本版积分规则 需要先绑定手机号

关闭

本站推荐上一条 /1 下一条

手机版|流式中文网 ( 浙ICP备17054466号-2 )

浙公网安备 33038202004217号

GMT+8, 2022-10-7 01:58

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2013 Comsenz Inc.