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[流式相关软件] flowjo收获的细胞很多,怎么让只显示1万个细胞?

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发表于 2013-10-28 23:19:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
1流星
如题

流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2013-10-29 08:53:42 | 显示全部楼层
设置flowjo显示细胞数其实很简单,只是由于我们平时都是用pesudocolor图,该类型的图片没有相关设置选项,所以都以为没有。其实如果把graph type改为dot plot(如下图),其右侧就会出现一个Num. Data设置项,输入你要显示的细胞数量即可。

设置flowjo显示数量

设置flowjo显示数量
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2013-10-29 10:57:41 | 显示全部楼层
本帖最后由 EthanMr 于 2013-10-29 11:00 编辑

求问细胞周期分析的软件有没有类似的功能?Modifit、FCS Express 好像都没有这个功能呢。或者有没有相应的软件可以将我收的3万细胞的“.fcs”文件导出其中1万细胞,然后再进行分析?
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2013-10-29 11:37:39 | 显示全部楼层
EthanMr 发表于 2013-10-29 10:57
求问细胞周期分析的软件有没有类似的功能?Modifit、FCS Express 好像都没有这个功能呢。或者有没有相应的 ...

flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件,另存为新的FCS文件,你可以用这种导出的FCS文件再在细胞周期分析软件中分析。

不过,这里得提一句,细胞周期分析反而应该用3万个更好。
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
发表于 2013-10-29 15:51:48 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-10-29 11:37
flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件,另存为新的FCS文件,你可以用这种导出的FCS文件再 ...

想问下倪老师,在用流式进行细胞计数,有需要注意的事情吗?特别是数微量细胞(10^5水平)
比如上样体积、流速控制等。
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发表于 2013-10-29 18:53:00 | 显示全部楼层
月下听蝉 发表于 2013-10-29 15:51
想问下倪老师,在用流式进行细胞计数,有需要注意的事情吗?特别是数微量细胞(10^5水平)
比如上样体积 ...

我们平时就做MRD时取过10万个细胞。上样体积、流式控制应该要求不高,不过老实说,在CANTO II上我曾发现慢速比高速要稳定很多,所以如果时间充足,慢速优选。
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发表于 2013-10-29 20:08:01 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-10-29 18:53
我们平时就做MRD时取过10万个细胞。上样体积、流式控制应该要求不高,不过老实说,在CANTO II上我曾发现 ...

我用AriaIII,配5激光,用的时候需要四激光四色来定位微量细胞,有时候细胞会少到10^3水平,但细胞总数会很多。就不知液流过快会不会对荧光的判读有影响,但太慢就要上样很久,经常得数3h以上。。
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2013-10-29 20:11:12 | 显示全部楼层
月下听蝉 发表于 2013-10-29 20:08
我用AriaIII,配5激光,用的时候需要四激光四色来定位微量细胞,有时候细胞会少到10^3水平,但细胞总数会 ...

我个人的感觉,速度越快,其CV值肯定要受到影响,所以只要细胞密度足够,我个人倾向用慢速。你可以试试减少上样体积(例如控制在300ul左右),这样细胞密度就比较高,在低速也能很快获取到目标数量的细胞。
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发表于 2013-10-29 21:14:11 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-10-29 20:11
我个人的感觉,速度越快,其CV值肯定要受到影响,所以只要细胞密度足够,我个人倾向用慢速。你可以试试减 ...

好的,多谢!
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发表于 2013-10-30 09:00:48 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-10-29 11:37
flowjo或者diva软件可以导出FCS文件中指定数量的事件,另存为新的FCS文件,你可以用这种导出的FCS文件再 ...

多谢倪老师。我也知道周期分析细胞多一些更好,但是在用Modifit分析的时候发现,收3万个细胞的话,多数分析结果的RCS值大于5%,收2万个细胞的话分析起来就会好一些。
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