modfit处理细胞周期数据

彩色糖纸

小白第一次做细胞周期，实验用的Hela细胞，在后期用modfit处理数据时，由于不会圈门，听师姐的就都圈了，但是分析后有四倍体和异倍体的峰，且RCS值较大，在6左右，尝试少圈点细胞时，倒是没有多倍体的峰了，但是RSC值高达40多，这是什么原因呢，这样的数据可以用吗

wxd

细胞周期分析可以多次尝试，每次用不同的方法进行分析。分析方法中，重点有三个，第一个是黏连细胞的去除，这个可以通过荧光通道的A和H的组合来实现，也可以通过A或者H与W的组合来实现，见图片2,；第二个是目标细胞群的选择，根据我分析的结果，二楼楼主的圈门方法可能有些不妥。第三个是荧光通道的选择，PI染色的细胞周期，不一定局限于PE通道，PC5也是可以分析的，也不局限于A，H也是可以的。有了数据，可以都分析一下，然后从分析结果中挑一个好的。

家的感觉

圈的门位置太大了，你这样圈试试

彩色糖纸

嗯，感谢回复，按您推荐的方法确实没有四倍体的峰了。
与之前对比，少了横坐标50的位置处的峰，请问这几个峰代表什么呢？

niwanmao

彩色糖纸 发表于 2022-1-2 19:45
嗯，感谢回复，按您推荐的方法确实没有四倍体的峰了。
与之前对比，少了横坐标50的位置处的峰，请问这几个 ...

你前面上传的untitled.zip里面的文件，只是modfit的模板，并不是FCS文件，所以无法分析。
从你附上来的图看，50的峰应该是在，不应该消失，50对应G0/G1，90附近对应G2/M

彩色糖纸

niwanmao 发表于 2022-1-3 11:53
你前面上传的untitled.zip里面的文件，只是modfit的模板，并不是FCS文件，所以无法分析。
从你附上来的图 ...

原来是这样，谢谢倪老师，我重新附上了FCS文件，希望能得到您的指导！十分感谢

彩色糖纸

wxd 发表于 2021-12-30 21:52
细胞周期分析可以多次尝试，每次用不同的方法进行分析。分析方法中，重点有三个，第一个是黏连细胞的去除， ...

明白了，十分感谢