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标题: 小鼠外周血检测MDSC如何分析 [打印本页]

作者: 小鹿    时间: 2020-5-9 09:44
标题: 小鼠外周血检测MDSC如何分析
      各位老师好,最近做一个小鼠外周血测MDSC的,原本是想免疫磁珠分选获得P-MDSC和G-MDSC,然后再流式分析LY6G和CD11b的MDSC表达。但是这边条件限制做不了分选,所以尝试着血样裂红标记LY6G和CD11b抗体直接检测。     之前浏览了大家小鼠MDSC主要标记GR-1CD11b,LY6G,LY6c,然后LY6G和CD11b在粒细胞、单核细胞都会表达,上机的时候也发现主要集中在“单核”那群细胞
      试着不同圈门分析得到以下结果,不确定哪种方式比较正确,或者我可以选中所有细胞,圈选CD11+,再看LY6G的表达情况吗?
      不知道有没有比较可行的方法不用分选,检测MDSC的?

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作者: 小鹿    时间: 2020-5-10 16:49
EI,实验经验不足,还望各位老师指导一下哈。
作者: niwanmao    时间: 2020-5-11 08:56
2017年回答过一个小鼠MDSC的问题,供参考:https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-6088-1-1.html
作者: 小鹿    时间: 2020-5-11 10:13
niwanmao 发表于 2020-5-11 08:56
2017年回答过一个小鼠MDSC的问题,供参考:https://www.flowcyto.cn/bbs/thread-6088-1-1.html ...

嗯嗯,谢谢老师,分析时有借鉴以上帖子,检测MDSC基础的都需要标记GR-1CD11b,LY6G,LY6c这4个吗?像我只标记LY6G和CD11b两个抗体的话来判断MDSC的是不是分群不够充分?
作者: liuruiluna    时间: 2020-5-11 16:09
做分析的话,本来也不用分选吧?直接标记抗体上机看比例么。
一般分选出来的,会拿传出来的细胞做下一步实验,比如培养了,提取蛋白或者RNA的,不了解为啥要分选之后再检测
作者: niwanmao    时间: 2020-5-11 17:54
小鹿 发表于 2020-5-11 10:13
嗯嗯,谢谢老师,分析时有借鉴以上帖子,检测MDSC基础的都需要标记GR-1CD11b,LY6G,LY6c这4个吗?像我只标 ...

只有Ly6G和CD11b分不开的。
作者: 小鹿    时间: 2020-5-12 09:44
liuruiluna 发表于 2020-5-11 16:09
做分析的话,本来也不用分选吧?直接标记抗体上机看比例么。
一般分选出来的,会拿传出来的细胞做下一步实 ...

本意可能是想获取总的MDSC细胞,然后看一下其中LY6G和CD11b分群的比例。
作者: 小鹿    时间: 2020-5-12 09:47
niwanmao 发表于 2020-5-11 17:54
只有Ly6G和CD11b分不开的。

好的,了解。感谢老师解答
作者: liuruiluna    时间: 2020-5-15 14:01
小鹿 发表于 2020-5-12 09:44
本意可能是想获取总的MDSC细胞,然后看一下其中LY6G和CD11b分群的比例。

这些都可以在不用分选的情况下直接流式分析出来。而且分选过程中也有丢失目标细胞的可能。我个人认为分选不是很必要
作者: 小鹿    时间: 2020-6-20 11:53
niwanmao 发表于 2020-5-11 17:54
只有Ly6G和CD11b分不开的。

     老师,我这次增加了两个指标,FITC anti-mouse Ly-6G;PerCP anti-mouse Ly-6C;PE anti-mouse/human CD11b;APC anti-mouse (Gr-1),
结果出来,参照以下两种方式分析:
1.从CD11b+,GR-1那群细胞选择看LY6C/LY6G阴阳性的比例,感觉没办法区分,只有一群细胞;
2.选择从CD11+这群选择看LY6C/LY6G,就有了明显分群;但是两种分析方式感觉结果差很远昂。
这个数据文件,麻烦您帮我看看[attach]20196[/attach]

[attach]20197[/attach]

[attach]20198[/attach]







作者: niwanmao    时间: 2020-6-22 08:59
小鹿 发表于 2020-6-20 11:53
老师,我这次增加了两个指标,FITC anti-mouse Ly-6G;PerCP anti-mouse Ly-6CE anti-mouse/human ...

还算可以的,能够分出:
[attach]20200[/attach]

作者: 小鹿    时间: 2020-6-22 10:36
老师,gMDSC跟mMDSC需要分开选取P3跟R5里分析么?我当时十字画门选取了CD11b+,Gr-1+细胞,然后选择LY6G/LY6C的通道得到您“2/p3”的那个图。这个是为什么呢?而且R5那群细胞感觉不是特别明显。
作者: niwanmao    时间: 2020-6-23 12:26
小鹿 发表于 2020-6-22 10:36
老师,gMDSC跟mMDSC需要分开选取P3跟R5里分析么?我当时十字画门选取了CD11b+,Gr-1+细胞,然后选择LY6G/LY6 ...

gMDSC和mMDSC性质不同,是需要P3和R5分开的。R5你放大看,其实是分群清楚的。
作者: 小鹿    时间: 2020-6-23 16:48
niwanmao 发表于 2020-6-23 12:26
gMDSC和mMDSC性质不同,是需要P3和R5分开的。R5你放大看,其实是分群清楚的。 ...

看到有文章描述MDSC标记CD11b/Gr-1也会分群差异的,那这个结果定义是这样吗?以下细胞群占PBMC比例为
1.总MDSC比值:P3+R5;
2.粒细胞MDSC:gMDSC(0.53%)*P3;
3.单核细胞MDSC:mMDSC(31.06%)*R5;

[attach]20207[/attach]


作者: niwanmao    时间: 2020-6-24 08:43
小鹿 发表于 2020-6-23 16:48
看到有文章描述MDSC标记CD11b/Gr-1也会分群差异的,那这个结果定义是这样吗?以下细胞群占PBMC比例为
1.总 ...

总MDSC=gMDSC+mMDSC的比例之和
其它两个对的。
作者: 小鹿    时间: 2020-6-24 14:50
niwanmao 发表于 2020-6-24 08:43
总MDSC=gMDSC+mMDSC的比例之和
其它两个对的。

按照这个算法:总MDSC:  31.59%
                       gMDSC:   0.21%
                       mMDSC:  1.64%
老师,我感觉我的逻辑要凌乱了;难道总MDSC不是gMDSC与mMDSC和吗??按照我之前的表述也不对。
作者: niwanmao    时间: 2020-6-25 09:19
小鹿 发表于 2020-6-24 14:50
按照这个算法:总MDSC:  31.59%
                       gMDSC:   0.21%
                       mMDSC:   ...

晕。我不知道你是怎么理解的。
我前面这个意思就是总MDSC=gMDSC+mMDSC=0.21+1.64=1.85%
作者: 小鹿    时间: 2020-6-26 08:58
niwanmao 发表于 2020-6-25 09:19
晕。我不知道你是怎么理解的。
我前面这个意思就是总MDSC=gMDSC+mMDSC=0.21+1.64=1.85% ...

奥奥,理解错了,我以为是说圈门那部分相加,谢谢老师解答。
作者: 345641775    时间: 2020-6-30 14:11
niwanmao 发表于 2020-6-25 09:19
晕。我不知道你是怎么理解的。
我前面这个意思就是总MDSC=gMDSC+mMDSC=0.21+1.64=1.85% ...

老师,圈门时我划的那些细胞可以也圈进去吗?这一堆细胞是什么细胞呢?





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